Procesamiento de Muestras (ADN)

La secuenciación de alta calidad requiere un material de partida excepcional. Ofrecemos directrices detalladas y consultoría para ayudarte a optimizar tus protocolos de extracción y preparación de ADN, personalizados para tipos de muestras específicos (ambientales, clínicas, bacterianas).

  • Optimización de extracción de ADN
  • Métricas y parámetros de control de calidad (QC)
  • Resolución de problemas de bajo rendimiento o contaminación
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Secuenciación Externa e In-House

Navegar por el panorama de la secuenciación puede ser abrumador. Brindamos consultoría para seleccionar los proveedores de secuenciación externa ideales y nos especializamos en metodologías clave. Además, proporcionamos una hoja de ruta para la transición hacia tecnologías Oxford Nanopore (ONT) in-house.

  • WGS en Colonias Bacterianas: Mapeo genómico de alta resolución para tipificación de cepas y anotación funcional.
  • Meta-Amplicón 16S ARNr: Perfilado taxonómico profundo de comunidades microbianas.
  • Secuenciación de Metagenomas: Comprensión del potencial funcional en microbiomas complejos.
  • Preparación para el futuro: Configuraciones ONT in-house para generación de datos de lectura larga en tiempo real.
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Pipelines de Procesamiento de Datos

Transformamos gigabytes de datos FASTQ crudos en información comprensible. Nuestra consultoría bioinformática establece pipelines robustos y reproducibles para tus tipos de datos específicos.

  • Pipelines personalizados en bash/Python para ensamblaje y anotación WGS
  • Pipelines DADA2/QIIME2 para procesamiento de amplicones 16S
  • Binning metagenómico (MAGs) y perfilado funcional
  • Control de calidad riguroso (Trimmomatic, FastQC, MultiQC)
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Reportes y Presentación de Datos

Los datos no tienen sentido si no se pueden comunicar de manera efectiva. Te ayudamos a diseñar reportes claros, interactivos y listos para publicación.

  • Reportes HTML interactivos y dashboards visuales
  • Gráficos de barras taxonómicos, PCA/PCoA para métricas de diversidad
  • Figuras de alta resolución listas para publicación
  • Resúmenes en lenguaje claro para las partes interesadas
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Precios y Cotizaciones

Debido a la naturaleza altamente personalizada de los proyectos de secuenciación y análisis bioinformático, todos nuestros servicios se cotizan a medida según los requerimientos específicos de su laboratorio y tipo de muestras.

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